Production
Le scénario a été écrit par Phil Hay et Matt Manfredi (auteurs de Crazy/Beautiful un film romantique et The Tuxedo un film d’action et de comédie), et dirigé par Karyn Kusama (réalisateur de Girlfight). Le personnages du Æon Flux a été joué par le gagnant d’un Oscar Charlize Theron. Ce film a été produit par MTV Films production. Il est inhabituel pour MTV Films production parce que c'est un film d'action.
L'actrice Michelle Rodríguez a été retenue pour jouer le personnage principal Æon. C'était peut-être lié à son association précédente avec le directeur Kusama dans Girlfight.
Karyn Kusama avait à l'origine suggéré le tournage à Brasília, Brésil parce que l'architecture de cette ville rappelle celle de la vision de Bregna. L'idée a été rejetée parce que Brasília a manqué de l'infrastructure et de l'expertise technique pour faciliter une production importante du film.
Après avoir observé plusieurs villes autour du monde, Berlin, Allemagne a été choisie comme endroit pour le tournage. C'était approprié car la série télévisée originale a également comporté une ville divisée. Berlin a plusieurs endroits qui ressemblent au monde organique du Æon Flux.
L'équipage pouvait accéder à plusieurs endroits qui n'avaient jamais été ouverts auparavant. Les endroits en question incluaient l'espace du handler, un amphithéâtre construit en 1790 pour la formation des vétérinaires et les bâtiments de l'ex-gouvernement de la RDA.